Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC12Q8WUD4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms