Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms