Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FNDC9Q8TBE3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNDC9Q8TBE3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms