Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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