Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms