Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms