Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2BQ8N4Y2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms