Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf62Q8N4C0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms