Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC18Q8N456 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC18Q8N456 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms