Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF444Q8N0Y2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF444Q8N0Y2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms