Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX4Q8IY92 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms