Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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RAB11FIP4Q86YS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP4Q86YS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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