Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIMS1Q86UR5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMS1Q86UR5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms