Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SETXQ7Z333 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms