Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HECW1Q76N89 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms