Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SSH2Q76I76 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms