Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf139Q6ZV77 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms