Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms