Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms