Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRAIDQ6UW56 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms