Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms