Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms