Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF7Q6Q0C0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF7Q6Q0C0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms