Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMOD2Q6P5Q4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD2Q6P5Q4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms