Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD2Q6NTF9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms