Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms