Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms