Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms