Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM69BQ5VUD6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM69BQ5VUD6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms