Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPRD2Q5VT52 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms