Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HES3Q5TGS1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms