Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPH4AQ5TD94 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms