Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHYHD1Q5SRE7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms