Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SAMD9Q5K651 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SAMD9Q5K651 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms