Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HABP4Q5JVS0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms