Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms