Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDK2Q58EX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms