Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP55Q53EZ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP55Q53EZ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms