Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SP6Q3SY56 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms