Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL38Q2WGJ6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms