Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETM2Q2VYF4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms