Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL40Q2TBA0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms