Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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