Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC142Q17RM4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC142Q17RM4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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