Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN1Q16799 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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RTN1Q16799 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN1Q16799 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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