Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms