Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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