Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYPL1Q16563 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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