Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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TAF1AQ15573 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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