Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CDSNQ15517 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CDSNQ15517 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDSNQ15517 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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